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每个人的生物识别资料是独一无二的，不可能遗忘、丢失或窃取，并且难以伪造，因此部分对安全要求高的机构将生物识别技术融入门禁控制系统中，加强身份认证。在亚太地区，越来越多行业开始部署集成生物识别技术的智慧卡技术，包括政府机构、边境管制、银行和医疗保健机构。
基于非接触式智能卡技术的生物识别读卡器可支援多种认证方式(密码+智能卡或密码+智能卡+指纹)，特别适合安全要求高的金融机构部门(如金库)，从而提高安全性，并符合法规要求。生物识别资料(如指纹模板)并非存储在中央伺服器上，而是持卡人的指纹模板寄存在智能卡内 (Match-On-Card)。进入门禁点时，持卡人须于读卡器拍卡及对指纹，持卡人的指纹须与智能卡内指纹模板吻合，才能开门。将指纹模板寄存在智能卡内，可避免黑客入侵系统，从而取得生物识别资料，提供更强大安防水平。
过去十年，市民对国家安防的日益关注，促使世界各地的政府不断完善现有安防政策，提高整体公共安防水平。目前生物识别技术已应用在入境检查，帮助政府监控边境出入，辨别出入境人员的身份。这也导致了电子护照的问世，这种护照内置了护照资讯的非接触式积体电路(IC)晶片，能帮助警员通过加密的生物识别资料验证护照持有人的身份。电子护照功提供了增强的安全性，护照持有人的个人资料和生物识别资料(包括照片、指纹或虹膜)能安全地存储在护照晶片中，并通过安全的非接触式技术访问。此外，其他政府部门亦使用生物识别技术来保障重要资产，例如中国珠海市金湾区人民检察院在存放支的地下室部署了HID iCLASS生物识别读卡器，以阻止未经授权的进入。用户必须通过证卡出示以及生物指纹进行双重身份验证来核实身份。这样可有效防止支失窃及追踪使用者，维持社会秩序。
现时，有部分企业使用生物识别读卡器用作考勤用途，识别持卡人身份，并纪录出勤纪录，生成报表。印度牙科理事会去年已在全国超过 290 间牙科学院采用了 HID 的SmartID生物识别读卡器和 EDGEPlus门禁控制器，识别员工身份，并统一记录全体教员的考勤，从而节省50% 的运营成本，并减少人为失误。印度牙科学院经常发生缺勤教职员虚报有值班，影响薪酬计算。HID 的解决方案使标准化中央识别系统使用指纹验证持卡人身份，防止虚报考勤记录，减少薪酬计算错误。SmartID生物识别读卡器接通EDGEPlus门禁控制器，再通过TCP/IP将门禁数据上传至中央管理站，能实时监控之余，亦避免了记录被篡改。
展望未来，我们可将生物识别技术嵌入智能手机内的虚拟凭证卡，进行身份验证，增加便携性。最近HID Global便与Iris ID虹膜识别技术供应商合作，将虹膜模板既存在iCLASS?虚拟凭证卡，并嵌入至NFC智能手机进行身份认证。嵌入到IrisAccess? iCAM7000虹膜Re平台的iCLASS?读卡器能读取BlackBerry? Bold? 9900/9930智能手机内配置的HID Global iCLASS?虚拟凭证卡，实现各种应用，例如大楼门禁丶考勤管理以及其他独立的身份识别应用程式。用户的虹膜模板存储在NFC黑莓智能手机内的 iCLASS虚拟凭证卡中，只需手持NFC黑莓智慧手机在iCAM7000系列虹膜摄像机前面读取，就可以进行身份验证，使用方法如同一般iCLASS智能卡。
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